Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gsc2P56916 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gsc2P56916 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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