Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc1a3P56564 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms