Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FmodP50608 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FmodP50608 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FmodP50608 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FmodP50608 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FmodP50608 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FmodP50608 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FmodP50608 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms