Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabrb1P50571 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms