Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox2P48432 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms