Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rom1P32958 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms