Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RxrgP28705 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RxrgP28705 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms