Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SlkO54988 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SlkO54988 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SlkO54988 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SlkO54988 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SlkO54988 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SlkO54988 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms