Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8888J3QPX5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms