Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5849J3QPE5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm5849J3QPE5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm5849J3QPE5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm5849J3QPE5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm5849J3QPE5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5849J3QPE5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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