Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms