Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim55G3X8Y1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms