Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms