Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2564F6Z9S8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms