Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa35E9QLQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa35E9QLQ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms