Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ApobE9Q414 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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