Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rd3lB2RV38 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms