Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AU015836B2RUM3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AU015836B2RUM3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms