Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF3BA8MYP8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms