Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdccag3A2AIW0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdccag3A2AIW0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms