Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc173A0JLY1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc173A0JLY1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms