Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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