Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc6Q9R087 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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