Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Six6Q9QZ28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Six6Q9QZ28 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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