Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms