Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms