Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim2Q9ESN6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim2Q9ESN6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms