Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ0

Suv39h2, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H2, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h2Q9EQQ0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h2Q9EQQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h2Q9EQQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms