Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan4Q9DCK3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan4Q9DCK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms