Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms