Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4bQ9D8B3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms