Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SarnpQ9D1J3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms