Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd3Q9D176 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms