Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms