Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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