Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BccipQ9CWI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BccipQ9CWI3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms