Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms