Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnpda2Q9CRC9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms