Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Chchd5Q9CQP3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Chchd5Q9CQP3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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