Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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