Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms