Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lysmd3Q99LE3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lysmd3Q99LE3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms