Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms