Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec3Q99J72 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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