Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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