Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd4lQ8CFI0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd4lQ8CFI0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms