Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoa5Q8C7G5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa5Q8C7G5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms