Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV1

Fam57b, Protein FAM57B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam57bQ7TNV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam57bQ7TNV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam57bQ7TNV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms