Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih3Q6ZWS4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnih3Q6ZWS4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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