Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc36Q6PDM4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc36Q6PDM4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc36Q6PDM4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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